Британские ученые разработали ПЦР-тест, определяющий штаммы коронавируса

На данный момент лучшими методами обнаружения вирусных вариантов считают полногеномное секвенирование нового поколения (NGS). Однако образцы для этих методов должны иметь хорошее качество и высокий уровень вирусной РНК. Об этом говорится в предварительных отчетах исследователей, опубликованных на портале medRxiv.org.

Отмечается, что зачастую взятые у пациентов пробы на поздних стадиях заболевания коронавирусом содержат низкий уровень вирусной РНК. Также эти методы дорогие, а значит недоступны для массового использования. Группа ученых разработала метод количественной полимеразной цепной реакции (ПЦР), который назвала аллель-специфический зондовый ПЦР. Благодаря разработке можно в реальном времени выявить вирусные варианты даже в таких образцах, у которых низкое содержание вирусной РНК или деградированная РНК.

В ходе испытаний ученые взяли 717 образцов пациентов, инфицированных SARS-CoV-2 в Великобритании, а также 365 образцов – в Бразилии. В первом случае они обнаружили в S-белке вируса мутацию D1118H, которая характерна для варианта «Альфа»,  во втором — мутации K417T и L3468V, свойственные для варианта «Гамма». По словам ученых, новый метод можно легко модифицировать под новые мутации, которые могут появиться в геноме SARS-CoV-2 в будущем. Авторы разработки подчеркнули, что это очень важно для оперативного отслеживания распространения новых штаммов коронавируса, пишет РИА Новости.